快看看,错误的细胞您有几株?附常用STR信息检索资料

2020-01-01 14:33:50发布

本文经生科达人编辑和校对。


       来自荷兰内梅亨大学的Willem Halffman和Serge Horbach发现了3万多篇关于这些错误的细胞的论文。相关研究结果于2017年10月12日发表在PLoS ONE期刊上,标题为“The ghosts of HeLa: How cell line misidentification contaminates the scientific literature”

       Willem Halffman和Serge Horbach想要知道这个问题到底有多严重。Halffman解释道,“我们研究了从1955年开始发表的关于错误标识的细胞系的科学论文。这些论文中的多数仍然在网上列出了这些错误的细胞,而且经常被其他的作者们引用。在经过广泛的文献研究之后,我们认为这涉及到大约3.3万篇论文。这意味着网上有超过3万篇科学论文在报道错误的细胞。”

      Horbach说,“大多数科学家都不是故意地发表关于错误的细胞的发现。这是一个诚实的错误。更令人担忧的问题是这些研究数据是潜在无效的,而且是不可能重复的。更可怕的是,我们半个世纪前就已知道这些错误标识的细胞,然而很多研究人员并没有意识到这一点。每周都会有新的关于错误标识的细胞的论文发表。”

       国际细胞系认证委员会(ICLAC),公布的交叉污染(错误鉴定)细胞系数据库(Misidentified Cell Lines Database),最新版本是 isVersion 9, released 14 October 2018

      大量研究表明STR基因分型方法,是进行细胞交叉污染和性质鉴定的最有效和准确的方法之一。STR基因分型应用于细胞鉴定已被ATCC等机构强烈推荐。目前,美国的ATCC细胞库、德国的DSMZ细胞库以及日本的JCRB细胞库等,为STR分型提供了各细胞株的数据供比对。


以下是生科达人翻译的简介,并提供免费下载:错误细胞库Excel原件、常用STR信息检索资料。

1、表格列出了,共计529种细胞系。

2、已努力排除合法地来自同一供体的细胞系-例如,如果一个细胞系是故意来自另一个细胞系。

3、486种细胞系被错误认定,找不到已知的原种,并列于表1中。

4、最初认为43个细胞系被误认,但此后发现了真实的原种。 这些细胞系在表2中单独列出。

5、60个细胞系与原始供体不符,但污染物未知。 54个细胞系来自不同物种。

6、列出了149种不同的污染物。 最常见的是HeLa(121个条目),其次是T-24(20个条目)和M14(18个条目)。


附件一:ICLAC公布的错误细胞系目录 Cross-Contaminations_v9_distribution.xlsx

附件二:常用STR信息检索资料.pdf


Tips:小鼠细胞无法做STR检测?

      小鼠细胞的STR检测标记,ATCC于2017年已有9个位点的专利发布。2019年6月,国际多家权威机构又发布了19个位点的信息,并且同时公布了21种小鼠细胞系的STR数据。可见并不是不能做,只是一没有可比对的数据库(尤其对于需要确认细胞系身份的科研工作者就觉得没必要做了),另外能够提供小鼠STR检测服务的第三方也很少。但即使如此,对于发文章的要求来说,能够率先提供查无可依的小鼠细胞STR,至少可以体现细胞没有交叉污染,并且可以接受同行的验证。这对于细胞的质量也是一种科学的控制。


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